Yui Morisaki adalah seorang siswi SMA di Akademi Shoutou, dan dia memiliki rahasia besar. Berkat sihirnya, dia dapat berubah menjadi gadis penyihir Pony Celes, dan secara diam-diam dia secara teratur melawan antek-antek jahat Zydarg. Menjaga rahasia ini dari semua orang biasa bukanlah hal yang mudah—terutama sekarang karena teman masa kecilnya, Ginga, akan tinggal bersamanya selama sebulan. Dan kemudian dia juga menyaksikan bagaimana Yui diserang dan dinodai oleh salah satu penjahat…
